Прогнозирование применимости ПЦР-ПДРФ-анализа для тестирования сортового многообразия виноградастатья из журнала
База данных: Каталог библиотеки СФУ (В 219)
Библиографическое описание: Вафин, Рамиль Ришадович. Прогнозирование применимости ПЦР-ПДРФ-анализа для тестирования сортового многообразия винограда / Рамиль Ришадович Вафин, Ирина Юрьевна Михайлова, Ирина Игоревна Агейкина. - (Механизмы повышения и контроля качества пищевой продукции). - Текст : непосредственный // Пищевая промышленность. - 2023. - № 1. - С. 6-9 : 2 рис., 3 табл. - Библиогр.: с. 8-9 (10 назв.). - ISSN 0235-2486.
Аннотация: Для геноидентификации технических сортов винограда может быть применен молекулярно-генетический анализ по локусу гена UFGT (UDP-glucose: flavonoid 3-O-glucosyltransferase - уридиндифосфат-глюкоза: флавоноид 3-О-глюкозилтрансфераза) Vitis vinifera L. длиной 705 нуклеотидов, насчитывающий 34 полиморфные позиции (1 INDEL и 33 SNPs). Тогда как при ДНК-аутентификации виноматериалов и вин целесообразен анализ локуса меньшей длины (из-за сильной фрагментации остаточных нуклеиновых кислот винограда, экстрагируемых из винного дебриса), затрагивающий 5 детектируемых полиморфных позиций (1 INDEL и 4 SNPs), интерпретация которых может позволить охарактеризовать 13 UFGT-ген-ассоциированных групп не только методом прямого секвенирования специфичного ПЦР-продукта, но и другими подходами, требующими отработки. Поэтому целью настоящего исследования являлась прогнозная оценка применимости ПЦР-ПДРФ-анализа для детекции 5 диагностически значимых полиморфных позиций и последующей идентификации 13 UFGT-ген-ассоциированных групп Vitis vinifera L. при тестировании сортового многообразия винограда, а также производимого из него виноматериала. Выделение ДНК из пробоподготовленного биоматериала может быть выполнено коммерческим набором innuPREP Plant DNA Kit, а постановка ПЦР с праймерами UFGT-F1 и UFGT-R2 - Phire Plant Direct PCR Master Mix. ПДРФ-анализ осуществляется с подобранными эндонуклеазами рестрикции (PstI, BsaXI, BtsIMutI и HinfI). Детекция ПЦР-ПДРФ-фрагментов выполняется визуализацией электрофореграмм в УФ-трансиллюминаторе. Выравнивание и рестрикционное картирование референсных нуклеотидных последовательностей локуса UFGT гена Vitis vinifera L. проведено с применением программ BLAST, ClustalW и NEBcutter V2. 0, с последующим моделированием соответствующих ПЦР-ПДРФ-профилей. В результате исследования установлено, что применимость ПЦР-ПДРФ-анализа для идентификации 13 UFGT-ген-ассоциированных групп Vitis vinifera L. прогнозируемо достигается подбором диагностически ценных эндонуклеаз рестрикции, каждая из которых способна дискриминировать определенную полиморфную позицию, включая последнюю, детектируемую благодаря модификации обратного праймера UFGT-R2, приводящего к искусственно создаваемому сайту рестрикции для HinfI при SNP c заменой цитозина (C) на гуанин (G). Исследования проводились в Межотраслевом научно-техническом центре мониторинга качества пищевых продуктов Всероссийского научно-исследовательского института пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности - филиала Федерального научного центра пищевых систем им. В. М. Горбатова РАН.
Год издания: 2023
Источник: Пищевая промышленность
Выпуск: № 1
Номера страниц: 6-9
Количество экземпляров:
- Читальный зал нормативной литературы и специальных наук (ул. Лиды Прушинской, 2, к.3-02): свободно 1 из 1 экземпляров
Ключевые слова: snp, Vitis vinifera L., ДНК-технологии, нии, пдрф, пцр, ПЦР-ПДРФ-анализ, виноград, виноматериалы, идентификация виноматериалов, идентификация растительного сырья, исследования, локусы гена UFGT, молекулярно-генетический анализ, научно-исследовательские институты, научно-технические центры, нуклеиновая кислота, применение ПЦР-ПДРФ-анализа, растительное сырье, секвенирование, сорта винограда, тестирование сортов винограда, электрофорез
Рубрики: Пищевые производства,
Бродильные производства
Бродильные производства
ISSN: 0235-2486
Идентификаторы: полочный индекс В 219, шифр pipr/2023/1-684528