Библиографическое описание:Farkov, Mikhail. Calculation of Force Field Grids for Molecular Docking Using Graphics Processing Unit = Вычисление сеток силовых полей для молекулярного докинга с использованием графических процессоров / M. A. Farkov. - Текст : непосредственный // Журнал Сибирского федерального университета. Биология. - 2014. - Т. 7, № 1. - С. 4-13. - Библиогр.: с. 12-13 (14 назв.). - ISSN 1997-1389.
Аннотация:Подавляющее большинство задач, с которыми приходится сталкиваться биоинформатике, чрезвычайно сложны и времязатратны. Для их успешного решения требуется использовать современные высокопроизводительные вычислительные системы, для которых необходимо разрабатывать новые, специфичные алгоритмы. Среди таких систем отдельную нишу занимают гетерогенные вычислительные системы, в состав которых входят графические процессоры. Подобные системы позволяют существенно ускорить вычисления некоторых задач. В работе представлены алгоритмы, использующие возможности графических процессоров для ускорения молекулярного докинга, а именно для построения сеток силовых полей для ускорения молекулярного лиганд-белкового докинга. Предложенные алгоритмы ориентированы на быстрое вычисление большого количества сеток силовых полей и масштабируются на любое доступное компьютеру количество графических процессоров.
