1. Главная
  2. Ресурсы
  3. Библиотечный поиск
Аннотация генома ипредсказание сайтовначала транскрипциидля лиственницысибирской (Larixsibirica Ledeb.) Бондар Евгения Ивановна2024 год

Аннотация генома и предсказание сайтов начала транскрипции для лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) : специальность ""
диссертация

Дополнительные ссылки: eLibrary
База данных: Каталог библиотеки СФУ
Библиографическое описание: Аннотация генома и предсказание сайтов начала транскрипции для лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) : специальность "" : диссертация на соискание ученой степени кандидат биологических наук / Е. И. Бондар ; ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ОБЩЕЙ ГЕНЕТИКИ ИМ. Н.И. ВАВИЛОВА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК. - , 2024. - 151 с. - .
Аннотация: Диссертационная работа Бондар Евгении Ивановны «Аннотация генома и предсказание сайтов начала транскрипции для лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.)» посвящена подробной аннотации генов и мобильных элементов генома лиственницы сибирской, что является первым публично доступным ресурсом для рода Larix. В данной работе была получена комплексная видоспецифичная библиотека повторов, которая может использоваться для поиска мобильных элементов в геномах других голосеменных растений, а также разработаны и протестированы полиморфные SSR-маркеры для лиственницы сибирской, подходящие также для популяционных исследований лиственниц Гмелина и Каяндера. Разработанные в ходе исследования SSR-маркеры позволяют оценивать уровень генетического разнообразия и дифференциации популяций и могут успешно применяться для изучения лиственниц сибирской, Гмелина и Каяндера и специально разработаны с учётом их возможного использования в лабораториях, где отсутствует техническая возможность проведения капиллярного электрофореза. Кроме этого, для трёх видов семейства Pinaceae были предсказаны сайты начала транскрипции с помощью вычислительных подходов, основанных на методе максимизации ожидания и классификации нейронной сетью; был опробован метод валидации предсказаний de novo на основе распределения длин 5′-нетранслируемой области, профиля распределения свободной энергии ДНК дуплексов и позиционного распределения сайтов связывания транскрипционных факторов. Эта работа является первым полногеномным предсказанием TSS в геномах размером более 10 млрд.п.н. Идентификация TSS и соответствующих промоторных областей является важным ресурсом для экспериментальной проверки и понимания регуляции генов, а также для исследования эволюционных связей между голосеменными и покрытосеменными растениями. Эта информация может быть использована в генетической селекции и редактировании генома для более точного картирования функциональных областей генома и локусов количественных признаков (QTL), таких как скорость роста, устойчивость к холоду и засухе, резистентность к патогенам и инвазии.
Год издания: 2024
Авторы: Бондар Евгения Ивановна
Авторский коллектив: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ОБЩЕЙ ГЕНЕТИКИ ИМ. Н.И. ВАВИЛОВА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК
Количество страниц: 151
Количество экземпляров:
Твёрдая копия издания отсутствует в фонде библиотеки

Похожие публикации

Проантоцианидины коры лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb): выделение и флавоноидный состав : статья из журнала

  • Левданский А. В. и др.
  • 2025 год
Генетическаяструктура игеографическаядифференциацияпопуляций лиственницысибирской (Larixsibirica Ledeb.) на… Новикова Серафима ВалерьевнаОрешкова Наталья ВикторовнаШаров Вадим Витальевич2023 год

Генетическая структура и географическая дифференциация популяций лиственницы сибирской (Larix… : научное издание

  • Новикова Серафима Валерьевна и др.
  • 2023 год
Бактериальныймикробиом филлосферылиственницы сибирской(Larix sibiricaLedeb.) в зоневлияния техногенныхэмиссий… Мирошникова К. А.Литовка Ю. А.Джалолов И. И.2025 год

Бактериальный микробиом филлосферы лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) в зоне влияния… : научное издание

  • Мирошникова К. А. и др.
  • 2025 год
ИЗУЧЕНИЕХЛОРОПЛАСТНОГО ГЕНОМАЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ(LARIX SIBIRICALEDEB.) И РАЗРАБОТКАПОЛИМОРФНЫХХЛОРОПЛАСТНЫХ… Бондар Евгения ИвановнаПутинцева Юлия АндреевнаОрешкова Наталья Викторовна2015 год

ИЗУЧЕНИЕ ХЛОРОПЛАСТНОГО ГЕНОМА ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (LARIX SIBIRICA LEDEB.) И РАЗРАБОТКА… : доклад, тезисы доклада

  • Бондар Евгения Ивановна и др.
  • 2015 год
Genetic Adaptation ofSiberian Larch (Larixsibirica Ledeb.) toHigh Altitudes Novikova Serafima V.Sharov Vadim V.Oreshkova Natalia V.2023 год

Genetic Adaptation of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) to High Altitudes : научное издание

  • Novikova Serafima V. и др.
  • 2023 год
Генетическоеразнообразиеценопопуляций Larixsibirica Ledeb. иPicea obovata Ledeb.на Таймыре Орешкова Наталья ВикторовнаСедельникова ТамараСтаниславовнаПименов Александр Владимирович2023 год

Генетическое разнообразие ценопопуляций Larix sibirica Ledeb. и Picea obovata Ledeb. на Таймыре : научное издание

  • Орешкова Наталья Викторовна и др.
  • 2023 год
Предсказание новыхсайтовN[эпсилон]-ацетилирования в протеомечеловека на основемолекулярныхдескрипторов… Лебедев Н. В.Филимонов Д. А.Поройков В. В.2025 год

Предсказание новых сайтов N[эпсилон]-ацетилирования в протеоме человека на основе молекулярных… : статья из журнала

  • Лебедев Н. В. и др.
  • 2025 год
Study of the GeneticAdaptation Mechanismsof Siberian Larch(Larix sibiricaLedeb.) RegardingClimatic Stresses… Novikova Serafima V.Oreshkova Natalia V.Sharov Vadim V.2023 год

Study of the Genetic Adaptation Mechanisms of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Regarding… : научное издание

  • Novikova Serafima V. и др.
  • 2023 год

Показать ещё

Внутриландшафтная изменчивость радиальных приростов лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.)… : статья из журнала

  • Кузнецова Е. П. и др.
  • 2011 год
Разработка ядерныхмикросателлитныхмаркеров с длинными(трех-, четырех-,пяти- ишестинуклеотидными)мотивами для… Орешкова Н.В.Бондар Е.И.Путинцева Ю.А.2019 год

Разработка ядерных микросателлитных маркеров с длинными (трех-, четырех-, пяти- и… : научное издание

  • Орешкова Н.В. и др.
  • 2019 год
ИЗМЕНЧИВОСТЬМАКРОСТРОБИЛОВЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ( Larix sibiricaLedeb.) В ГОРНЫХЦЕНОПОПУЛЯЦИЯХМОНГОЛИИ И… Барченков Алексей ПавловичМилютин Леонид ИосифовичЖамъянсурен Сандагдорж2015 год

ИЗМЕНЧИВОСТЬ МАКРОСТРОБИЛОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ ( Larix sibirica Ledeb.) В ГОРНЫХ ЦЕНОПОПУЛЯЦИЯХ… : научное издание

  • Барченков Алексей Павлович и др.
  • 2015 год
ВЛИЯНИЕ КЛИМАТИЧЕСКИХФАКТОРОВ НАТЕРМИЧЕСКИЕПОКАЗАТЕЛИ BETULATORTUOSA LEDEB. ИLARIX SIBIRICALEDEB.,… Тютькова Е.А.Лоскутов С.Р.Петров И.А.2020 год

ВЛИЯНИЕ КЛИМАТИЧЕСКИХ ФАКТОРОВ НА ТЕРМИЧЕСКИЕ ПОКАЗАТЕЛИ BETULA TORTUOSA LEDEB. И LARIX SIBIRICA… : научное издание

  • Тютькова Е.А. и др.
  • 2020 год
Генетическаяадаптация популяцийлиственницы сибирской(Larix sibiricaLedeb.) кгетерогенной среде Новикова С. В.Орешкова Н. В.Шаров В. В.2023 год

Генетическая адаптация популяций лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) к… : доклад, тезисы доклада

  • Новикова С. В. и др.
  • 2023 год
Сравнительная реакцияприроста лиственницы(Larix sibiricaLedeb.) на измененияклимата в лесостепи ивысокогорьях… Харук Вячеслав ИвановичПетров Илья АндреевичДвинская Мария Леонидовна2018 год

Сравнительная реакция прироста лиственницы (Larix sibirica Ledeb.) на изменения климата в лесостепи… : научное издание

  • Харук Вячеслав Иванович и др.
  • 2018 год
Влияниефитопатогенного грибаPorodaedaleaniemelaei намикробиом лиственницы(Larix sibiricaLedeb.),произрастающей… Мирошникова К. А.Литовка Ю. А.Павлов И. Н.2023 год

Влияние фитопатогенного гриба Porodaedalea niemelaei на микробиом лиственницы (Larix sibirica Ledeb.), произрастающей…

  • Мирошникова К. А. и др.
  • 2023 год
Изучение генетическойадаптации впопуляцияхлиственницы сибирской(Larix sibiricaLedeb.) сиспользованиемданных… Новикова С.В.Шаров В.В.Орешкова Н.В.2022 год

Изучение генетической адаптации в популяциях лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) с… : доклад, тезисы доклада

  • Новикова С.В. и др.
  • 2022 год