MOLECULAR IDENTIFICATION OF WOOD-DECAYING FUNGI OF ARMILLARIA GENUS WIDESPREAD IN EASTERN SIBERIA AND THE FAR EAST OF RUSSIA USING ITS, IGS-1-1 AND TEF-1A GENETIC MARKERS : научное издание
Библиографическое описание:MOLECULAR IDENTIFICATION OF WOOD-DECAYING FUNGI OF ARMILLARIA GENUS WIDESPREAD IN EASTERN SIBERIA AND THE FAR EAST OF RUSSIA USING ITS, IGS-1-1 AND TEF-1A GENETIC MARKERS : научное издание / A. I. Kolesnikova [et al.]. - Текст : непосредственный // Микология и фитопатология. - 2024. - Т.58, №3. - P. 231-245. - This study was supported by research grants № 14.Y26.31.0004 from the Russian Federation Government for the “Genomics of the key boreal forest conifer species and their major phytopathogens in the Russian Federation” project and № 16-04-01400 from the Russian Foundation for Basic Research. The funding sources that supported this work did not have any involvement in the design, acquisition, or analysis of data or the writing of the manuscript. - ISSN 0026-3648, DOI 10.31857/S0026364824030052.
Аннотация:The genus Armillaria is an essential component of forest ecosystems playing very important ecological role in dead wood decomposition, but it often becomes a serious pathogen causing white root rot in trees. It is also known that Armillaria species significantly differ in the level of pathogenicity. Thus, accurate identification of Armillaria is critical for assessing the risk of tree disease. In this study we analyzed 28 Armillaria isolates from Siberia and the Far East using nucleotide sequences of ITS, IGS-1-1 and TEF-1a gene regions and generated phylogenetic trees based on maximum likelihood method. In total, four Armillaria species were identified: A borealis, A. cepistipes, A. ostoyae and A. gallica. A. borealis was the most frequent among collected isolates (18 out of 28 isolates). A. gallica, A. cepistipes and A. ostoyae were much less frequent with two, five and three isolates out of 28, respectively. Thedistribution of Armillaria species in Siberia and the Far East was described for the first time. It is concluded that further studies are necessary to determine the role of Armillaria in trees pathological dieback, and A. borealis should be a key focus.
Род Armillaria является важным компонентом лесных экосистем, играя очень важную экологическую роль в разложении валежной древесины, но часто становится серьезным патогеном, вызывающим белую корневую гниль деревьев. Также известно, что виды Armillaria значительно различаются по уровню патогенности. Таким образом, точная идентификация Armillaria имеет решающее значение для оценки риска заболевания деревьев. В данном исследовании мы проанализировали 28 изолятов Armillaria из Сибири и Дальнего Востока с использованием нуклеотидных последовательностей участков генов ITS, IGS-1-1 и TEF-1a и построили филогенетические деревья на основе метода максимального правдоподобия. Всего было идентифицировано четыре вида Armillaria: A. borealis, A. cepistipes, A. ostoyae и A. gallica. Среди собранных изолятов наиболее часто встречался A. borealis (18 из 28 изолятов). A. gallica, A. cepistipes и A. ostoyae встречались значительно реже: два, пять и три изолята из 28 соответственно. Впервые описано распространение видов Armillaria в Сибири и на Дальнем Востоке. Сделан вывод о том, что необходимы дальнейшие исследования для определения роли Armillaria в патологическом отмирании деревьев, и A. borealis должен быть в центре внимания.
Издательство:Российская академия наук, Санкт-Петербург
Источник:Микология и фитопатология
Выпуск:Т.58, №3
Номера страниц:231-245
Держатель оригинала документа:Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences”, G.F. Morozov Voronezh State University of Forestry and Technologies, Georg-August University of Gottingen, Institute of Fundamental Biology and Biotechnology, Siberian Federal University, N.I. Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences, Reshetnev Siberian State University of Science and Technology, V.N. Sukachev Institute of Forest, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences
Количество экземпляров:
Твёрдая копия издания отсутствует в фонде библиотеки
