Библиографическое описание:ВЛИЯНИЕ ВЯЗКИХ СРЕД НА КВАНТОВЫЙ ВЫХОД БИОЛЮМИНЕСЦЕНЦИИ В РЕАКЦИИ, КАТАЛИЗИРУЕМОЙ БАКТЕРИАЛЬНОЙ ЛЮЦИФЕРАЗОЙ : научное издание / А. Е. Лисица [и др.]. - Текст : непосредственный // Биофизика. - 2024. - Т.69, №3. - С. 455-465. - Исследование частично выполнено при финансовой поддержке Министерства науки и высшего образования РФ (государственное задание № FWES-2024-0018). - ISSN 0006-3029, DOI 10.31857/S0006302924030047.
Аннотация:На основе данных по нестационарной кинетике биолюминесцентной реакции, катализируемой люциферазой <i>P. leiognathi</i>, в средах с полиолами и сахарами с помощью математического моделирования был определен относительный квантовый выход биолюминесценции в этой реакции на молекулу субстратов. Получено, что в некоторых средах относительный квантовый выход на молекулу альдегида растет по сравнению со значением в буфере: на 18% в присутствии глицерина и на 33% - в присутствии сахарозы. Методами молекулярной динамики была проанализирована конформация боковой цепи αHis44 - важного для катализа остатка бактериальных люцифераз. Установлено, что в присутствии всех сорастворителей наблюдается повышение вероятности образования оптимальной для катализа конформации этого аминокислотного остатка, что может способствовать наблюдаемому увеличению квантового выхода биолюминесценции изучаемой реакции в вязких средах.
Based on previously obtained data on the transient kinetics of the bioluminescent reaction catalyzed by P. leiognathi luciferase in media with polyols and sugars, the relative quantum yield of bioluminescence per substrate molecule was determined using mathematical modeling. It was found that in some media the relative quantum yield per aldehyde molecule increases compared to the value in the buffer: by 18% in the presence of glycerol and by 33% in the presence of sucrose. The conformation of the side chain of αHis44, which is the functionally important and conservative in all bacterial luciferases, was analyzed using molecular dynamics methods. It has been established that in the presence of all cosolvents there is an increase in the probability of formation the optimal for catalysis orientation of this amino acid, which may contribute to the observed increase in the quantum yield of bioluminescence in viscous media.
Издательство:ФИЦ "Пущинский научный центр биологических исследований РАН", Российская академия наук, Отделение биохимии, биофизики и химии физиологически активных соединений РАН, Москва
Источник:Биофизика
Выпуск:Т.69, №3
Номера страниц:455-465
Держатель оригинала документа:Институт биофизики СО РАН - обособленное подразделение ФИЦ «Красноярский научный центр Сибирского отделения РАН», Сибирский федеральный университет
Количество экземпляров:
Твёрдая копия издания отсутствует в фонде библиотеки
Ключевые слова:bacterial bioluminescence, quantum yield of bioluminescence, luciferase, Effect of medium, бактериальная биолюминесценция, квантовый выход биолюминесценции, люцифераза, эффект среды
