1. Главная
  2. Ресурсы
  3. Библиотечный поиск
Population geneticvariation ofmicrosatellitemarkers developed forSiberian fir (Abiessibirica Ledeb.) andEuropean silver fir …: научное издание Oreshkova Natalia V.Bondar Eugenia I.Sharov Vadim V.2023 год

Population genetic variation of microsatellite markers developed for Siberian fir (Abies sibirica Ledeb.) and European silver fir (Abies alba Mill.) using whole genome sequencing data : научное издание
статья из журнала

Дополнительные ссылки: eLibrary
База данных: Каталог библиотеки СФУ
Библиографическое описание: Population genetic variation of microsatellite markers developed for Siberian fir (<i>Abies sibirica</i> Ledeb.) and European silver fir (<i>Abies alba</i> Mill.) using whole genome sequencing data : научное издание / Natalia V. Oreshkova [et al.]. - Текст : непосредственный // Plant Genetic Resources: Characterisation and Utilisation. - 2023. - Т.21, №2. - P. 149-158. - ISSN 1479-2621. - ISSN 1479-263X, DOI 10.1017/s1479262123000552.
Аннотация: <jats:title>Abstract</jats:title><jats:p>The article presents the results of the search for microsatellite or simple sequence repeat (SSR) loci with tri-, tetra-, penta- and hexanucleotide tandem repeat motifs in the draft <jats:italic>de novo</jats:italic> assembly of the Siberian fir (<jats:italic>Abies sibirica</jats:italic> Ledeb.) genome and the development of convenient relatively highly and moderately polymorphic markers that can be easily genotyped even by simple gel electrophoresis. In total, 64 pairs of oligonucleotide polymerase chain reaction (PCR) primers for 32 detected microsatellite loci were designed and tested. Based on the testing results, 10 most promising polymorphic loci were selected and genotyped in eight natural populations of Siberian fir. Homologous microsatellite loci in the genome of European silver fir (<jats:italic>Abies alba</jats:italic> Mill.) were also identified by mapping Siberian fir contigs, containing SSR loci to the European silver fir genome assembly. A multiplex panel of 14 universal microsatellite loci was developed and genotyped in samples from four natural populations of <jats:italic>A. alba</jats:italic> and a small sample of eight Nordmann fir (<jats:italic>Abies nordmanniana</jats:italic> (Steven) Spach) trees.</jats:p>
Год издания: 2023
Авторы: Oreshkova Natalia V., Bondar Eugenia I., Sharov Vadim V., Dhungana Sudha P., Gailing Oliver, Krutovsky Konstantin V.
Издательство: CABI Publishing
Источник: Plant Genetic Resources: Characterisation and Utilisation
Выпуск: Т.21, №2
Номера страниц: 149-158
Держатель оригинала документа: G. F. Morozov Voronezh State University of Forestry and Technologies, Georg-August University of Göttingen, N. I. Vavilov Institute of General Genetics, Siberian Federal University
Количество экземпляров:
Твёрдая копия издания отсутствует в фонде библиотеки

Похожие публикации

The mitochondrialgenome sequence ofAbies alba Mill.reveals a highstructural andcombinatorialvariation Kersten BirgitRellstab ChristianSchroeder Hilke2022 год

The mitochondrial genome sequence of Abies alba Mill. reveals a high structural and combinatorial… : научное издание

  • Kersten Birgit и др.
  • 2022 год
Development ofMicrosatelliteGenetic Markers inSiberian Stone Pine(Pinus sibirica DuTour) Based on the denovo… Belokon M.M.Politov D.V.Mudrik E.A.2016 год

Development of Microsatellite Genetic Markers in Siberian Stone Pine (Pinus sibirica Du Tour)… : статья из журнала

  • Belokon M.M. и др.
  • 2016 год
Development ofNuclearMicrosatelliteMarkers with Long(Tri-, Tetra-,Penta-, andHexanucleotide)Motifs for Three… Oreshkova N.V.Bondar E.I.Putintseva Yu. A.2019 год

Development of Nuclear Microsatellite Markers with Long (Tri-, Tetra-, Penta-, and Hexanucleotide… : статья из журнала

  • Oreshkova N.V. и др.
  • 2019 год
Somaclonal variationof haploid in vitrotissue cultureobtained fromSiberian larch (Larixsibirica Ledeb.)… Krutovsky Konstantin V.Tretyakova Iraida N.Oreshkova Nataliay V.2014 год

Somaclonal variation of haploid in vitro tissue culture obtained from Siberian larch (Larix… : статья из журнала

  • Krutovsky Konstantin V. и др.
  • 2014 год
A Reference GenomeSequence for theEuropean Silver Fir(Abies alba Mill.): ACommunity-GeneratedGenomic Resource Mosca ElenaCruz FernandoGomez-Garrido Jessica2019 год

A Reference Genome Sequence for the European Silver Fir (Abies alba Mill.): A Community-Generated… : научное издание

  • Mosca Elena и др.
  • 2019 год
Development ofMicrosatelliteGenetic Markers inSiberian Larch (Larixsibirica Ledeb.)Based on the de novoWhole… Oreshkova N.V.Putintseva Yu. A.Sharov V.V.2017 год

Development of Microsatellite Genetic Markers in Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Based on… : научное издание

  • Oreshkova N.V. и др.
  • 2017 год
STUDY OF ARMILLARIABOREALISPATHOGENICITY BY THECOMPARATIVE WHOLEGENOME SEQUENCING Putintseva Yu.A.Pavlov I.N.Oreshkova N.V.2016 год

STUDY OF ARMILLARIA BOREALIS PATHOGENICITY BY THE COMPARATIVE WHOLE GENOME SEQUENCING : доклад, тезисы доклада

  • Putintseva Yu.A. и др.
  • 2016 год
THE WHOLE DE NOVOGENOME SEQUENCING ANDASSEMBLY OF SIBERIANLARCH (LARIX SIBIRICALEDEB.) AND SIBERIANPINE (PINUS… Oreshkova N.V.Putintseva Yu.A.Kuzmin D.A.2015 год

THE WHOLE DE NOVO GENOME SEQUENCING AND ASSEMBLY OF SIBERIAN LARCH (LARIX SIBIRICA LEDEB.)… : доклад, тезисы доклада

  • Oreshkova N.V. и др.
  • 2015 год

Показать ещё

Annotation ofSiberian Larch (Larixsibirica Ledeb.)Nuclear Genome—One ofthe MostCold-Resistant TreeSpecies in… Bondar E.I.Feranchuk S.I.Miroshnikova K.A.2022 год

Annotation of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Nuclear Genome—One of the Most Cold… : статья из журнала

  • Bondar E.I. и др.
  • 2022 год
Sequence Capture ofMitochondrial Genomewith PCR-GeneratedBaits Provides NewInsights into theBiogeography of the… Semerikov V.L.Semerikova S.A.Khrunyk Y.Y.2022 год

Sequence Capture of Mitochondrial Genome with PCR-Generated Baits Provides New Insights into the… : статья из журнала

  • Semerikov V.L. и др.
  • 2022 год
Дендрохронологическаядатировка инвазииPolygraphus proximusBlandford(Coleoptera:Curculionidae,Scolytinae) в… Ефременко А.А.Демидко Д.А.Кудрявцев П.П.2024 год

Дендрохронологическая датировка инвазии Polygraphus proximus Blandford (Coleoptera: Curculionidae… : статья из журнала

  • Ефременко А.А. и др.
  • 2024 год
Risk Modeling for theEmergence of thePrimary Outbreak Areaof the Siberian MothDendrolimus sibiricusTschetv. in… Goroshko Andrey A.Sultson Svetlana M.Ponomarev Evgenii I.2025 год

Risk Modeling for the Emergence of the Primary Outbreak Area of the Siberian Moth Dendrolimus… : научное издание

  • Goroshko Andrey A. и др.
  • 2025 год
The potential threatsposed by the invasivebark beetlePolygraphus proximus(Coleoptera,Curculionidae:Scolytinae)… Ponomarev V.I.Tolkach O.V.Klobukov G.I.2024 год

The potential threats posed by the invasive bark beetle Polygraphus proximus (Coleoptera,… : научное издание

  • Ponomarev V.I. и др.
  • 2024 год
Genetic polymorphismof mountain-taigapopulations ofsiberian stone pinein Kusnetsky Alatau Oreshkova N.V.Sedelnikova t.S.Efremov S.P.2021 год

Genetic polymorphism of mountain-taiga populations of siberian stone pine in Kusnetsky Alatau : научное издание

  • Oreshkova N.V. и др.
  • 2021 год
Genetic Adaptation ofSiberian Larch (Larixsibirica Ledeb.) toHigh Altitudes Novikova Serafima V.Sharov Vadim V.Oreshkova Natalia V.2023 год

Genetic Adaptation of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) to High Altitudes : научное издание

  • Novikova Serafima V. и др.
  • 2023 год
Разработка ядерныхмикросателлитныхмаркеров с длинными(трех-, четырех-,пяти- ишестинуклеотидными)мотивами для… Орешкова Н.В.Бондар Е.И.Путинцева Ю.А.2019 год

Разработка ядерных микросателлитных маркеров с длинными (трех-, четырех-, пяти- и… : научное издание

  • Орешкова Н.В. и др.
  • 2019 год