Изучение генетической адаптации деревьев к стрессовым средовым факторам на основе полногеномного и дендрохронологического анализа в контексте глобального изменения климата
Библиографическое описание:Изучение генетической адаптации деревьев к стрессовым средовым факторам на основе полногеномного и дендрохронологического анализа в контексте глобального изменения климата. - [Б. м. : б. и.], 2019. - Б. ц. - Текст : непосредственный.
Аннотация:Понимание индивидуальной генетической адаптации деревьев к средовым стрессам, таким как засуха или атака вредителей, очень важно для понимания того, насколько лесные насаждения адаптированы к глобальному потеплению климата, признаками которого являются участившиеся катастрофические засухи в российских лесах, часто сопровождаемые массовыми эпифитотиями и нашествиями насекомых-вредителей. Дендрохронологический анализ на основе изучения годового кольцевого прироста древесины позволяет оценить индивидуальный ответ деревьев на экологические стрессы, такие как засуха и массовое нашествие насекомых-вредителей и выделить индивидуальные дендрофенотипы, изменчивость которых может быть прокоррелирована с изменчивостью по большому числу молекулярно-генетических маркёров, генотипы которых будут определены одним из методов полногеномного секвенирования (RADseq).??В предложенном проекте планируется проанализировать генетическую основу индивидуальной реакции деревьев лиственницы сибирской в лесостепной зоне Республики Хакасия на повторяющиеся засухи (1930, 1932, 1946, 1959, 1965, 1974 гг.), вызвавшие сильную депрессию роста вплоть до отмирания части деревьев. В частности, планируется проанализировать прирост лиственницы на 3-5 участках вдоль подножия Батеневского кряжа (Ширинский, Боградский, Усть-Абаканский районы), не менее 25-30 деревьев на участок. Будут выявлены дендрофенотипы, наиболее устойчивые к засухам, т.е. с меньшей депрессией прироста и быстрым восстановлением нормального роста. Мы планируем прогенотипировать путём секвенирования ДНК деревьев с различными дендрофенотипами и проанализировать связь с ними полиморфных генетических маркёров, главным образом однонуклеотидных полиморфизмов (т.н. «снипс» - от английского «single nucleotide polymorphisms» или коротко SNPs, произносимых как «snips»). Участки генома в которых будут обнаружены эти маркёры будут проаннотированы и в тех случая, если они находятся в важных функциональных генах будет возможность определить предполагаемый генетический механизм устойчивости к температурному стрессу и степень распространения в популяциях такой устойчивости. Выявленные генотипы, связанные с устойчивостью могут быть затем использованы в мониторинге лесных популяций и в селекции на более устойчивые древесные породы для лесного хозяйства. Представленное исследование уникально и в российских бореальных лесах не проводилось. У коллектива проекта есть большой опыт в дендрохронологии и геномике, и успешный опыт совместных дендрогенетических исследований. Необходимо также отметить, что участниками проекта был получен референсный геном лиственницы сибирской, который был ассемблирован и аннотирован в лаборатории лесной геномики СФУ в рамках мегагранта под руководством проф. К. В. Крутовского, что значительно облегчает выполнение поставленных задач и гарантирует успех предлагаемого проекта.
Год издания:2019
Количество экземпляров:
Твёрдая копия издания отсутствует в фонде библиотеки
