Набор реактивов для оценки эффективности терапии ингибиторами тирозинкиназы при Ph-позитивных новообразованиях и способ его использования : патент на изобретение
Дополнительные ссылки: eLibrary
База данных: Каталог библиотеки СФУ
Библиографическое описание: Набор реактивов для оценки эффективности терапии ингибиторами тирозинкиназы при Ph-позитивных новообразованиях и способ его использования : патент на изобретение / А. В. Комина, И. А. Ольховский, А. С. Горбенко, М. А. Столяр ; патентообладатель Общество с ограниченной ответственностью «ГеноТрек». - № 2020120515 ; Заявл. 19.06.2020. - [Б. м. : б. и.], 2021. - Текст : непосредственный.
Аннотация: <p> <b></b> </p> <p>Изобретение относится к молекулярной биологии, биотехнологии и медицине, в частности к гематологии, онкологии, и может применяться для оценки эффективности терапии Ph-позитивных онкогематологических заболеваний. Набор для мультиплексного ПЦР анализа уровня экспрессии химерных молекул РНК с одновременным выявлением мутаций резистентности к терапии ИТК, а также ускоренного и экономичного способа диагностики Ph-позитивных онкогематологических заболеваний на его основе содержит буферный раствор, дезоксинуклеотидтрифосфаты, специфичные праймеры, TaqMan зонды, Taq-полимеразу, MgCI<sub>2</sub> и воду в оптимальных соотношениях, обеспечивающих оптимальную работу фермента. Способ оценки эффективности терапии ингибиторами тирозинкиназ при Ph-позитивных новообразованиях с использованием заявленного набора включает также проведение амплификации в следующем температурном режиме: предварительная денатурация 95°С – 5 минут; 50 циклов реакции в режиме 95°С – 15 с, 60°С – 40 с. Количественную оценку доли химерной ДНК рассчитывают исходя из значений пороговых циклов Ct в реакциях амплификации фрагментов BCR-ABL1 и ABL1, где количество копий ABL1 рассчитывают по формуле: IS(%)=(N(BCR-ABL1)/N(ABL1))⋅1,265⋅100. При определении уровня BCR-ABL1 выше 1% делается вывод о наличии резистентости пациента к используемым препаратам ИТК. В случае если одновременно выявленная разность значений Ct (исследуемой мутации) и Ct(ABL1) для любой из выявляемых мутаций меньше заданного критического порога, делается вывод, что выявленная мутация или комбинация мутаций является причиной данной резистентности. Техническим результатом, достигаемым заявляемым изобретением, является изготовление набора реактивов для мультиплексной ПЦР в реальном времени, позволяющего в одной аналитической постановке произвести количественную оценку уровня химерного транскрипта BCR-ABL1 в пробе крови, а также выявление 8 мутаций резистентности к ИТК - G250E, Y253H, E244K, E255V, T315I, F317L, F359I, F359V - для оценки эффективности терапии, что позволит при сокращении времени исследования и затрат материалов получить более полную информацию о течении заболевания. 2 н.п. ф-лы, 9 табл., 4 ил., 3 пр.</p>
<p>FIELD: molecular biology; biotechnology; medicine.</p> <p>SUBSTANCE: invention relates to molecular biology, biotechnology and medicine, in particular to hematology, oncology; it can be used for the estimation of the efficiency of the therapy of Ph-positive oncohematological diseases. A set for a multiplex PCR analysis of an expression level of chimeric RNA molecules with simultaneous detection of mutations of resistance to tyrosine kinase inhibitor (hereinafter – TKI) therapy, as well as an accelerated and economical method for the diagnostics of Ph-positive oncohematological diseases based on it, contains a buffer solution, deoxynucleotide triphosphates, specific primers, TaqMan probes, Taq-polymerase, MgCI<sub>2</sub> and water in optimal ratios providing an optimal enzyme work. A method for the estimation of the efficiency of the therapy with tyrosine kinase inhibitors at Ph-positive neoplasms using the claimed set also includes the amplification in the following temperature mode: preliminary denaturation – 95°C – 5 minutes; 50 reaction cycles in the mode of 95°C – 15 s, 60°C – 40 s. A quantitative assessment of a chimeric DNA fraction is calculated based on values of threshold Ct cycles in amplification reactions of BCR-ABL1 and ABL1 fragments, where a number of ABL1 copies is calculated according to the formula: IS(%)=(N(BCR-ABL1)/N(ABL1))·1.265·100. when BCR-ABL1 level of more than 1% is determined, it is concluded that a patient has resistance to used TKI preparations. In the case if simultaneously detected difference of values of Ct (mutation under study) and Ct (ABL1) for any of detected mutations is less than the set critical threshold, it is concluded that the detected mutation or mutation combination is a cause of this resistance.</p> <p>EFFECT: manufacture of the reagent set for multiplex PCR in real time, allowing, in one analytical setting, for quantitative assessment of the level of chimeric BCR-ABL1 transcript in the blood sample, as well as detection of 8 mutations of TKI resistance – G250E, Y253H, E244K, E255V, T315I, F317L, F359I, F359V – for the estimation of the therapy efficiency, which allows, while reducing research time and material costs, for obtaining more complete information about the disease course.</p> <p>2 cl, 9 tbl, 4 dwg, 3 ex</p>
<p>FIELD: molecular biology; biotechnology; medicine.</p> <p>SUBSTANCE: invention relates to molecular biology, biotechnology and medicine, in particular to hematology, oncology; it can be used for the estimation of the efficiency of the therapy of Ph-positive oncohematological diseases. A set for a multiplex PCR analysis of an expression level of chimeric RNA molecules with simultaneous detection of mutations of resistance to tyrosine kinase inhibitor (hereinafter – TKI) therapy, as well as an accelerated and economical method for the diagnostics of Ph-positive oncohematological diseases based on it, contains a buffer solution, deoxynucleotide triphosphates, specific primers, TaqMan probes, Taq-polymerase, MgCI<sub>2</sub> and water in optimal ratios providing an optimal enzyme work. A method for the estimation of the efficiency of the therapy with tyrosine kinase inhibitors at Ph-positive neoplasms using the claimed set also includes the amplification in the following temperature mode: preliminary denaturation – 95°C – 5 minutes; 50 reaction cycles in the mode of 95°C – 15 s, 60°C – 40 s. A quantitative assessment of a chimeric DNA fraction is calculated based on values of threshold Ct cycles in amplification reactions of BCR-ABL1 and ABL1 fragments, where a number of ABL1 copies is calculated according to the formula: IS(%)=(N(BCR-ABL1)/N(ABL1))·1.265·100. when BCR-ABL1 level of more than 1% is determined, it is concluded that a patient has resistance to used TKI preparations. In the case if simultaneously detected difference of values of Ct (mutation under study) and Ct (ABL1) for any of detected mutations is less than the set critical threshold, it is concluded that the detected mutation or mutation combination is a cause of this resistance.</p> <p>EFFECT: manufacture of the reagent set for multiplex PCR in real time, allowing, in one analytical setting, for quantitative assessment of the level of chimeric BCR-ABL1 transcript in the blood sample, as well as detection of 8 mutations of TKI resistance – G250E, Y253H, E244K, E255V, T315I, F317L, F359I, F359V – for the estimation of the therapy efficiency, which allows, while reducing research time and material costs, for obtaining more complete information about the disease course.</p> <p>2 cl, 9 tbl, 4 dwg, 3 ex</p>
Год издания: 2021
Авторы: Комина Анна Владимировна, Ольховский Игорь Алексеевич, Горбенко Алексей Сергеевич, Столяр Марина Александровна
Авторский коллектив: Общество с ограниченной ответственностью «ГеноТрек»
Держатель оригинала документа: Общество с ограниченной ответственностью «ГеноТрек»
Количество экземпляров:
Твёрдая копия издания отсутствует в фонде библиотеки
Классификационные коды: ГРНТИ 34
Идентификаторы: шифр 47487316
Похожие публикации
Способ диагностики острых лейкозов и наборы для его выполнения : патент на изобретение
- Ольховский Игорь Алексеевич и др.
- 2023 год