Библиографическое описание:Transcriptomic analysis of melanoma cells extracted from different sites of the primary tumor : научное издание / Maria B. Aksenenko [et al.]. - Текст : непосредственный // Сибирский онкологический журнал. - 2018. - Т.17, №4. - P. 59-66. - The study was supported by the Russian Foundation for Basic Research (project № 16-44-242056), the Krasnoyarsk Territory Government and Krasnoyarsk Regional Fund for Support of scientific and Scientific-Technical Activities (additional agreement № 15/16 to the special-purpose financing agreement № 11 dated 12.08.2016). Conflict of interest The authors declare that they have no conflict of interest. - ISSN 1814-4861. - ISSN 2312-3168, DOI 10.21294/1814-4861-2018-17-4-59-66. Перевод заглавия: Транскриптомный анализ клеток меланомы, полученных из различных участков первичной опухоли
Аннотация:Introduction. Intratumor heterogeneity is a characteristic feature for most malignant tumors, including cutaneous melanoma. This property represents one of the main obstacles for effective targeted therapy, due to the different sensitivity to chemotherapeutic agents on various tumor cells subclones. Treatment of malignant tumors requires an individual approach to choose the most appropriate treatment regimen. The purpose of the study was to evaluate differences in melanoma tissue samples obtained from different parts of one patient’s primary tumor at the transcriptomic level. Material and Methods. Melanoma cell cultures obtained from both central and peripheral parts of the primary tumor of two patients were used in the study. Results. Subclones from different parts of the first patient’s tumor were similar, whereas the second patient demonstrated significant differences at the transcriptomic level (in 2953 transcripts out of 48226). In the cells of the central zone of the second patient’s tumor, an increase in mRNA of the genes encoding proteins associated with tumor-specific immune response, as well as ABC-family transport proteins and cytokine signaling molecules, were noted. In the cells from the peripheral area of the same tumor, a more intensive transcription of genes encoding extracellular matrix and inflammatory response proteins was observed. Taken all round, the differences between the subclones of the second patient’s cells were relevant to some signaling cascades playing a leading role in oncogenesis (MAPK, PI3K-Akt-mTOR, VEGFA-VEGFR2, etc.). Conclusion. The study allowed evaluation of differences between cancer cells within a tumor at the transcriptional level in order to search for further approaches to personalized melanoma therapy.
Введение. Внутриопухолевая гетерогенность представляет собой характерную черту большинства злокачественных новообразований, в том числе и меланомы кожи. Данное свойство является одним из препятствий для проведения эффективной таргетной терапии, поскольку у различных субклонов опухолевых клеток наблюдается вариабельная чувствительность к данным препаратам. С современных позиций терапия злокачественных новообразований требует персонифицированного подхода для каждого конкретного пациента. цель исследования - оценка возможных различий между тканями меланомы, выделенными из различных участков первичной опухоли одного пациента на транскриптомном уровне. материалы и методы. В работе были использованы культуры клеток меланомы, полученные из центральной и периферической частей первичной опухоли двух пациентов. Исследование транскриптомов клеток проводили методом микрочипирования с последующим биоинформатическим анализом. Результаты. В клетках меланомы первого пациента, полученных из центрального и периферического участка одной опухоли, не было выявлено различий по транскриптомному профилю. У второго пациента имели место существенные различия (по 2953 транскриптам из 48226). В клетках, полученных из центрального участка опухоли, выявлено повышение мРНК генов, кодирующих белки, ассоциированные с иммунным ответом опухоли, транспортные белки AbC-семейства, сигнальные молекулы класса цитокинов. В культуре клеток, выделенной из периферического участка этой же опухоли, зарегистрировано увеличение уровня мРНК генов, кодирующих белки внеклеточного матрикса и воспалительного ответа. В целом различия между субклонами клеток второго пациента касались ряда сигнальных каскадов, играющих ведущую роль в онкогенезе (MAPK, PI3K-Akt-mTOR, VEgFAVEgFR2 и др). Заключение. Проведенное исследование позволяет оценить возможные различия между клетками внутри опухоли на транскрипционном уровне с целью поиска новых подходов для персонифицированной терапии.
Издательство:Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН, Томск
Источник:Сибирский онкологический журнал
Выпуск:Т.17, №4
Номера страниц:59-66
Держатель оригинала документа:A.I. Kryzhanovsky Krasnoyarsk Region Clinical Oncology Center, Professor V.F. Voino-Yasenetsky Krasnoyarsk State Medical University» of the Ministry of Health Care of the Russian Federation
Количество экземпляров:
Твёрдая копия издания отсутствует в фонде библиотеки
