Библиографическое описание:Анализ профилей микроРНК у пациентов с меланоцитарными новообразованиями кожи : научное издание / М. Б. Аксененко [и др.]. - Текст : непосредственный // Онкология. Журнал им. П.А. Герцена. - 2017. - Т.6, №1. - С. 23-27. - Работа выполнена при поддержке Российского научного фонда (проект № 14-15-00074). - ISSN 2305-218X. - ISSN 2309-4745, DOI 10.17116/onkolog20176123-27. Перевод заглавия: Analysis of microRNA profiles in patients with melanocytic skin neoplasms
Аннотация:МикроРНК являются модуляторами многих биологических процессов, нарушение экспрессии и активности микроРНК определяется при многочисленных патологических состояниях и заболеваниях. Цель исследования — оценка профиля экспрессии микроРНК при меланоме кожи и доброкачественных меланоцитарных новообразованиях кожи, анализ сигнальных путей и генов мишеней, регулируемых измененными микроРНК при меланоме. Материал и методы. Материалом для данного исследования стали образцы ткани меланомы кожи (n=7) и доброкачественных меланоцитарных новообразований кожи (n=6). Образцы ткани были стабилизированы в растворе RNLater («Ambion», США). На первом этапе исследования проводили выделение РНК из ткани пациентов, далее — микрочипирование при помощи GeneAtlas Microarray System («Affymetrix», CA, США). Для валидации результатов микрочипирования выбраны 3 микроРНК: miR-363-3p, miR-513a-5p, miR-3591-3p. Для анализа сигнальных путей и генов мишеней использованы базы данных DIANA-miRPath v.3,0. Результаты. Профилирование микроРНК меланомы и доброкачественных меланоцитарных новообразований выявило 62 микроРНК, уровни которых изменены в меланоме по сравнению с невусами. Из них 31 микроРНК показала повышенные уровни экспрессии, 31 — сниженные в меланоме по сравнению с меланоцитарными невусами. При помощи биоинформационного анализа определены 48 измененных механизмов передачи сигнала в образцах меланомы по сравнению с меланоцитарными невусами. Таким образом, сравнительная оценка характера экспрессии микроРНК позволяет идентифицировать новые молекулы-мишени для целенаправленного воздействия с целью модуляции различных процессов, ассоциированных с канцерогенезом.
MicroRNAs are modulators of many biological processes; impairment in microRNA expression and activity is detected in diverse pathological conditions and diseases. Objective: to evaluate microRNA expression profiles in cutaneous melanoma and benign melanocytic skin tumors and to analyze signaling pathways and target genes regulated by altered microRNAs in melanoma. Material and methods. The material for this investigation was tissue samples of cutaneous melanoma (n=7) and benign melanocytic skin neoplasms (n=6). The tissue samples were stabilized in RNLater solution («Ambion», USA). In the first stage of the investigation, RNA was isolated from the patients’ tissues; then microarray analysis was performed using GeneAtlas Microarray System («Affymetrix», CA, USA). To validate microarray results, three microRNAs, such as miR-363-3p, miR-513a-5p, miR-3591-3p, were selected. DIANA-miRPath v.3.0 database was used to analyze signaling pathways and target genes. Results. MicroRNA profiling in the melanoma and benign melanocytic neoplasms revealed 62 microRNAs, the levels of which were altered in melanoma as compared to nevi. Of these, 31 miRNAs were upregulated whilst 31 miRNAs were downregulated in melanoma as compared to melanocytic nevi. Bioinformatic analysis identified 48 altered mechanisms of signal transmission in the samples of melanoma as compared to those of melanocytic nevi. Therefore, comparative assessment of miRNA expression patterns can identify new target molecules for targeted exposure in order to modulate various processes associated with carcinogenesis.
