Библиографическое описание:Разработка метода определения аллельной нагрузки соматической мутации V617F в гене JAK2 (янус-киназы-2) в пулах проб венозной крови / А. С. Горбенко [et al.]. - Текст : непосредственный // Лабораторная служба. - 2016. - Т. 5, № 1. - С. 19-25. - ISSN 2305-2198. - ISSN 2309-4842. Перевод заглавия: Developing method for allelic somatic mutations burden of Janus kinase 2 (V617F JAK2) detection in pools of venous blood samples
Аннотация:Тест на выявление мутаций в гене JAK2 включен в клинические рекомендации ВОЗ в качестве одного из основных диагностических критериев хронических миелоидных опухолей. Вместе с тем, распространенность мутации V617F JAK2 среди добровольцев, не имеющих онкогематологического заболевания, составляет от 0,15 до 1,2%. При этом отсутствуют сведения об эффективности молекулярно-генетических скрининговых исследований для выявления мутации V617F JAK2 при тестировании пулированных образцов. Цель работы — сравнение результатов анализа мутации V617F JAK2, полученных при использовании разработанного метода и коммерческих наборов российских производителей, а также демонстрация возможности использования разработанной методики для анализа указанной мутации в пулированных образцах венозной крови. Материалы и методы. С целью выявление мутации V617F в гене JAK2 использовали разработанный в нашей лаборатории набор реактивов для метода аллель-специфической полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР-РВ). Результаты. Продемонстрирована возможность проведения скрининга в пулированных образцах венозной крови. Показана высокая корреляция (R2 от 0,86 до 0,94) результатов количественного определения аллельной нагрузки V617F JAK2 с результатами, полученными в тех же пробах при использовании коммерческих наборов для ПЦР-РВ производства ООО «НПК Синтол» и ООО «ГеноТехнология», а также с результатами теста количественного пиросеквенирования фирмы «Интерлабсервис». Среди 485 «неинтерпретируемых» или «отрицательных» в тест-системе ООО «НПФ Литех» результатов тестирования 44 были положительными при использовании альтернативных наборов. При этом уровень аллельной нагрузки V617F JAK2 в этих пробах находился в пределах клинической значимости от 0,24 до 40,4% (Ме =9,6%). Выводы. Предел аналитической чувствительности (0,06%) и близкая к 100% (р0,001) специфичность, а также высокая корреляция количественных результатов «in house» метода с коммерческими наборами, позволяет предложить его использование при тестировании пулов проб крови в скрининге пациентов с клинически значимыми уровнями аллельной нагрузки мутации V617F JAK2.
Identification of mutations in the JAK2 gene is included in the WHO recommendations by as one of the main diagnostic criteria for chronic myeloid neoplasms. However, the prevalence of JAK2 V617F mutation among volunteers without hematologic malignancies is from 0,15% to 1,2%. At the same time there is no information on the effectiveness of molecular genetic screening studies to identify mutations V617F JAK2 when testing pooled samples. The limit of analytical sensitivity (0,06%) and close to 100% (р0,001), specificity, as well as a high correlation with the quantitative results of a commercial kits, allows us to offer an option “in house” method in testing pools of blood samples in screening patients with clinically significant levels of the allelic burden.
Издательство:Общество с ограниченной ответственностью Издательство Медиа Сфера, Москва
Источник:Лабораторная служба
Выпуск:Т. 5, № 1
Номера страниц:19-25
Держатель оригинала документа:«Городская клиническая больница №7», Красноярск, «Красноярский ГМУ им. проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого» Минздрава России, Красноярск, «Красноярский научный центр Сибирского отделения РАН», Красноярск, «Сибирский федеральный университет», Красноярский филиал «Гематологический научный центр» Минздрава России, Красноярск, Красноярский филиал «Гематологический научный центр» Минздрава России, Красноярск, Россия, Красноярский филиал ФГБУ «Гематологический научный центр» Минздрава России
Количество экземпляров:
Твёрдая копия издания отсутствует в фонде библиотеки
