1. Главная
  2. Ресурсы
  3. Библиотечный поиск
  4. Журнал Сибирского федерального университета. Биология
  5. Выпуск 2022 г. Том 15. № 1

Компьютерная обработка и анализ сканированных проб зоопланктона: методические рекомендации
статья из журнала

Полный текстЗаказать копию статьи
База данных: Каталог библиотеки СФУ (Z 99)
Библиографическое описание: Ёлгина, О. Е. Компьютерная обработка и анализ сканированных проб зоопланктона: методические рекомендации = Computer Processing and Analysis of Scanned Zooplankton Samples: Guidelines / О. Е. Ёлгина, А. П. Толомеев, О. П. Дубовская. - Текст : непосредственный // Журнал Сибирского федерального университета. Биология. - 2022. - Т. 15, № 1. - С. 5-30 : 10 рис. - Библиогр.: с. 27-30. - ISSN 1997-1389.
Аннотация: Разработаны методические рекомендации для компьютерного анализа получаемых в результате сканирования проб зоопланктона изображений с помощью программного обеспечения ImageJ/Fiji и ilastik. Приведены инструкции для постобработки первичного отсканированного материала, процедур сегментирования и создания коллекций изображений зоопланктеров с целью последующего распознавания в модуле Object Classifiction / ilastik. Предлагаемая методика оптимизирует работу с большими файлами изображений в высоком разрешении благодаря созданию коллекций и упрощает задачу построения классификатора. Методика оказалась эффективной для решения задачи изучения пространственного распределения размерной структуры популяции копепод Arctodiaptomus salinus в оз. Шира. Кроме того, методика тестировалась на пробах естественного зоопланктона озер Северо-Минусинской котловины (Республика Хакасия), имеющих разные видовой состав и численность планктонных организмов. Возможности видовой идентификации зоопланктеров по сканированным пробам были ограничены, однако в сочетании с традиционной микроскопией метод биоимидж-анализа (БИА) также позволяет выполнять исследования таксономической структуры зоопланктона. На основе результатов тестирования приводится обсуждение преимуществ, ограничений и перспектив развития методов БИА для обработки проб зоопланктона.
Год издания: 2022
Авторы: Ёлгина О. Е. , Толомеев А. П. , Дубовская О. П.
Источник: Журнал Сибирского федерального университета. Биология
Выпуск: Т. 15, № 1
Номера страниц: 5-30
Количество экземпляров:

Всего свободно 3 из 3 экземпляров.

  • Информационно-библиографический отдел (пр. Свободный, 79, к. Б3-09): свободно 1 из 1 экземпляров
  • Читальный зал (ул. Ак. Вавилова, 47Б): свободно 1 из 1 экземпляров
  • Информационно-библиографический отдел (ул. Лиды Прушинской, 2, к. 3-06): свободно 1 из 1 экземпляров