- Главная
- Ресурсы
- Библиотечный поиск
- Журнал Сибирского федерального университета. Биология
- Выпуск 2024 г. Том 17. № 1
Виртуальная in silico ПЦР в двумерном формате как инструмент для выяснения филогенетического родства у аллополиплоидных форм на примере пшениц и их диких сородичей эгилопсовстатья из журнала
База данных: Каталог библиотеки СФУ (В 526)
Библиографическое описание: Виртуальная in silico ПЦР в двумерном формате как инструмент для выяснения филогенетического родства у аллополиплоидных форм на примере пшениц и их диких сородичей эгилопсов = Virtual In Silico PCR in Two-Dimensional Format as a Tool for Elucidating Phylogenetic Relationship in Allopolyploid Forms with Wheats and Their Wild Relatives Aegilops Used as an Example / О. Ю. Кирьянова, А. Р. Кулуев, И. М. Губайдуллин [и др.]. - Текст : непосредственный // Журнал Сибирского федерального университета. Биология. - 2024. - Т. 17, № 1. - С. 45-63 : 6 рис.; 5 табл. - Библиогр.: с. 62-63. - ISSN 1997-1389.
Аннотация: Определение природных доноров трех субгеномов BAD мягкой пшеницы (Triticum aestivum L.) имеет большое значение в целях разработки технологий по дальнейшему усовершенствованию данной культуры. До сегодняшнего дня остаются открытыми некоторые вопросы происхождения субгеномов B и A мягкой пшеницы, тогда как донором субгенома D считается Aegilops tauschii подвид strangulata. Для установления видов- доноров субгеномов полиплоидных форм активно применяется сравнение нуклеотидных последовательностей различных генов, а также фрагментов повторяющейся ДНК, что позволяет строить филогенетические древа. Однако в этом случае в анализ берется лишь одна или несколько генетических систем или локусов. Предложенное нами геномное штрихкодирование, не привязанное к какой-либо генетической системе, имеет преимущество, поскольку in silico RAPD-анализ «находит» одинаковые по размеру участки сразу всего генома, делая как бы его полный «срез». Для оценки филогенетического родства разных видов пшеницы использовали метод виртуального мультиплексного RAPD-анализа с 20 ундекамерными праймерами, что позволило создать геномные штрихкоды этих видов, сопровождаемые двумерными картами, составленными для отдельных хромосом анализируемой пшеницы. Предложенный метод компьютерного анализа геномов показал, что T. aestivum субгеном D и Ae. tauschii весьма схожи между собой, что подтверждает их общее происхождение. В случае с донорами субгеномов А и В такие однозначные выводы сделать не удалось, что, возможно, связано с более древним объединением этих субгеномов в тетраплоидной пшенице и накоплением за это время большего количества мутаций.
Год издания: 2024
Авторы: Кирьянова О. Ю. , Кулуев А. Р. , Губайдуллин И. М. , Кулуев Б. Р. , Чемерис А. В.
Выпуск: Т. 17, № 1
Номера страниц: 45-63
Количество экземпляров:
Всего свободно 3 из 3 экземпляров.
- Информационно-библиографический отдел (пр. Свободный, 79, к. Б3-09): свободно 1 из 1 экземпляров
- Электронный читальный зал (пер. Вузовский, 3, к. 131): свободно 1 из 1 экземпляров
- Информационно-библиографический отдел (ул. Лиды Прушинской, 2, к. 3-06): свободно 1 из 1 экземпляров
Ключевые слова: in silico RAPD-анализ, аллополиплоидные формы , геномное штрихкодирование, компьютерное моделирование ПЦР, родство филогенетическое , филогенетическое родство , формы аллополиплоидные
Рубрики: Биология,
Общая систематика,
Общая физиология
Общая систематика,
Общая физиология
Классификационные коды: ГРНТИ 34
ISSN: 1997-1389
Идентификаторы: полочный индекс В 526, шифр jsfb/2024/17/1-444695083